上海市林业总站隶属于上海市绿化和市容管理局（上海市林业局），1979年经市编委批准成立，是集行政管理，检疫执法和林业技术推广于一体的全额事业单位，加挂上海市林业病虫防治检疫站、上海市林木花卉育种中心两块牌子。下设综合办公室、计划财务科、组织人事科、科技教育科、测报检疫科、林木种苗科、果树管理科、资源建管科、花卉质检科、产业办公室等综合部门和业务科室，编制为80名，在编职工73名，拥有专科以上学历67名， 其中博士1名、硕士17名、本科33名，另外，拥有正高级职称5人、副高级职称14人、中级职称23人、中级以下职称18人。

主要承担业务有：

1. 负责全市林业有害生物预警与防控；

2. 负责全市森林资源培育与经营；

3. 负责全市林木种苗行业管理与指导；

4. 负责全市果树花卉技术指导与管理；

5. 负责全市林产品质量监督与林业标准化建设；

6. 负责全市林业服务体系与行业工种技能鉴定等职能；

7. 受上海市绿化和市容管理局（上海市林业局）委托，承担全市林业项目检查与验收、出省木材运输证办理、林木种子种苗经营与生产许可证后续监管等局下达行政职能延伸的工作；

8. 完成国家林业局以及所属的森防总站、种苗总站和林业工作总站等林业业务主管部门下达给各省市开展的日常性管理工作。